Prednosti NTFSa:
<ul><li>veća otpornost: ukoliko ti se komp zronda, nečeš imati brdo lost clustera i file sistem u komi, već češ eventualno ostati bez onoga po čemu je trenutno pisao i disk check nije potreban (poput onog ScanDiska na fatu)</li><li>imaš mogućnost postavljanja brojnih security opcija</li><li>on line enkripcija i kompresija fileova bez dodatnog softwarea</li><li>možeš raditi fileove veće od 4GB<li><li>možeš bolje baratati sa veličinom clustera</li><li>indexing - brže pretraživanje po disku</li></ul>
Mane NTFSa (malo ih je, ali boli glava!):
<ul><li>često sporiji pristup od FATa</li><li>ne možeš bootati DOS i čistiti viruse</li><li>Linux kernel ne voli pisati po njemu i postoji mogućnost da će se nešto sj.....</li><li>linuxov ext3 i Reiser su mnogo brži i koliko znam (na veliku žalost) ne može ih se koristiti u Windozama</li></ul>