Pa neke posebne svrhe od razdvajanja Program Filesa baš i nema jer nakon nove instalacije Windowsa pola toga sigurno neće uopće raditi, nešto će raditi, ali će izgubiti sve postavke itd. Problem je u tome što ima dosta programa koji prilikom instalacije svoje datoteke ostave i na drugim mjestima (Windows folder i registry npr.), ne samo u Program Filesu, a brisanjem toga se gubi i na funkcionalnosti programa.
Pročitaj dobro što te traži u Disk Managementu jer mislim da se radi o basic i dynamic načinu rada. Naravno, treba ti basic.