Zato sto ti je sad vjerojatno opet ukljucen uefi ( zahtjeva gpt format diska ) a windowsi su instalirani u legacy modu koji zahtjeva mbr format diska, ukljuci legacy ponovo i bootat ces.
Da si napravio ispravan uefi boot usb uopce ne bi bilo potrebe za legacy modeom, iskljucivanjem ahci-a itd.