Pa mislim da si sam dobro napravio dijagnozu..ocito struja koja ide od napajanja ima negdje neki "short", a od strane baterije je uredan. Nisam te jedino razumio da li kada je matična "gola" odnosno kad je van kučišta da li imaš probleme sa podizanjem sustava ili je to samo kad je zavidan na to podnožje?
Ako matična uredno radi kad je van kučišta onda se vjerojatno javlja negdje neki kratki spoj kad se spoji kučište, i to da kučište dodiruje neki kondenzator ili slično. Dodatno, probaj povaditi sve kabele sa matične i zavidaj samo matičnu na kučište i vidi jel radi...ne spajaj nikakve usb portove i zvučnike koji su odvojeni od matične, samo matičnu zavidaj sa par vida na kučište. Ukoliko takva radi onda je moguće da je problem u tim zvucnicima ili usb-ovima koji se spajaju na matičnu da je kod njih neka greška ali naravno može biti i da je na matičnoj kod spoja, ali ćeš bar eliminirati problem.
Ali ukoliko imaš problema i kada je matična odvojena od kučišta sa dizanjem sustava onda je sigurno problem u napajanja od matične, neki mosfet, kondenzator ili slično. E za to ti treba shema napajanja matične i nešto znanja sa multimetrom i mjerenjem i ideš korak po korak dok ne izoliraš gdje je greška...