1. Probaj istu stvar (dual boot i ostalo) napraviti na ATA/IDE disku pa ćeš onda malo više ući u srž problema jer, ako se problem ponovi i na tom disku, barem ćeš znati da je novi disk OK.
2. Upozorenje, ako to budeš radio: svi podaci na disku na koji se klonira će nestati nakon kloniranja. Ako imaš nešto važno na novom disku, snimi negdje (možeš vratiti na stari disk). Pažljivo sve čitaj što ti bude pisalo i manualno (ručno) namjesti sve stavke. Tako ćeš imati kontrolu nad svime.
3. Naredba fixmbr popravlja samo XP-ov boot sektor. Vjerojatno će ti se obrisati Linuxov, ali imaš već link za repair...
Prijedloge na dnu sam pisao povezano - redom radiš 1, 2 i 3. Nemoj preskakati ništa...