Na Scrabook homepageu imaš objašnjene sve opcije i funkcije, ne bi bilo loše da to proučiš.
http://amb.vis.ne.jp/mozilla/scrapbook/
Što se tiče deptha - to je broj linkova koliko duboko od osnovne domene će ti se sejvati stranice. Koliki broj ćeš postaviti ovisi o samoj strukturi sajta koji skidaš, o tome što želiš u biti skinuti itd.
Btw. ako netko želi probati još jedan način za skidanje cijelih sajtova, možete probati SpiderZilla Firefox ekstenziju.