Guglaj mkv tools, koliko se sjećam s njim se i muxa i demuxa.
uglavnom, vrlo vjerojatno ti ne treba konverter jer mkv ti je samo container, a koristi se zato jer u njega možeš utrpati i video, nekoliko audio traka, titlove i poglavlja i sve ti je na jednom. video koji je unutra je vjerojatno obični avi (makar ne mora biti) tak da tebi samo treba nešto čime ćeš izbaciti video, zvuk i titlove u zasebne fajlove i onde to muxati u običan avi.