Pogledaj prvo da li imaš bookmarke u folderu:
C:\Documents and Settings\User Name\Application Data\Mozilla\Firefox\Profiles\xxxxxxxx.default
Prvo njih negdje kopiraj, a zatim pokreni Firefox preko switcha -p, možda su se samo profili pobrkali.
Meni se tak nešto nikad nije dogodilo, da ne ureknem sad...
