Ako ti utrošeno vrijeme nije problem, a hoćeš iskoristiti te diskove za manje bitne podatke, zašto ne.
Evo prijedlog, pretpostavka da si barem malo na ti s linuxom:
1. ATA secure erase
https://ata.wiki.kernel.org/index.php/ATA_Secure_Erase
Ovo će prepisati kompletnu površinu diska i srediti eventualne pending i slične sektore koji možda čekaju u zasjedi.
2. dalje opcionalno testiranje, npr. badblocks ili tako nešto ako hoćeš biti sigurniji u te diskove. Može i nekakvi fio i slični benchmark alati koji drgljaju puno po diskovima. Pustiš pola dana pa ako prežive ih ostaviš

Npr. ovaj ima fora ideju, ali nisam probao:
https://github.com/ezonakiusagi/bht