Ja sam nekad davno imao taj problem, da se kod pisanja na spori medij (USB npr.) linux zakoči na neko vrijeme. Točno je bio opisani slučaj da kernel odluči npr., od 16GB RAM potrpati valjda 15 i pol u file cache i onda kad ga krene prazniti na USB stick sve stane. Ako se kopira kroz neki GUI onda prividno kopiranje u startu ide nekom nenormalnom brzinom, a dalje usporava dok se ne stabilizira na realnoj brzini kojom se može zapisivati na device.
Ali je to bilo jako davno, ima već dosta godina da nisam primijetio nikakva usporenja. Možda je do drugog hardvera, novijih kernela, do responzivnijeg BFQ schedulera ili su negdje drugdje nešto popravili. Ili do stickova jer doma koristim Sandisk Extreme koji je ipak dosta brz.