Prije bih rekao da je neki bug u pitanju. Ako si testirao disk i 100% si siguran da je ispravan te greskice se nebi smjele pojavljivat neovisno o vanjskoj ladici. Vise mi smrdi interni USB 3 cip na MBO. Sjecam se da sam sa prvim generacijama imao gadnih problema - OS nije ni vidio vanjski HDD vise, jedino hard reset svih kernel modula vezanih uz USB je pomogao. Dali se problem manifestira i kod ostalih distri (tu me prije svega zanima nesto tipa Fedora i/ili Arch) ? Ako je disk ustekan kod boota dali imas problem da boot malo duze traje? Ima li sta sumnjivog u dmesg outputu?
https://bugzilla.redhat.com/show_bug.cgi?id=1585361