Ovo da ti ga "neda" isključiti / odjaviti je poznati win štos, ovo bi ti trebalo pomoći:
a) daj sistemu vremena da (sa zakašnjenjem) odradi šta si mu dao, npr. da iskopira ili sl., pogotovo ako koristiš win explorer
b) nakon obavljenog "posla" selektiraj drugi hdd / prebaci "fokus" na drugi hdd, na ovaj način "oslobodio" si ovaj drugi hdd
Ova gore procedura bi ti trebala barem malo popraviti navedeni prosjek.