Na šta misliš pod konvertiranje, samo prebacivanje između formata ili na promjenu rezolucije. Ako samo prebacivaš onda TsMuxer i MkvMerge. Sa muxerom napraviš demux kojih hoćeš stremova (video, audio, prijevodi) i onda sa mkvmergom napraviš mkv od tih stremova.
Sa Handbrejkom možeš konvertirati na drugi format tipa divx/xvid sa promjenom rezolucije.