Pokušaj sa starijom verzijom MKVToolnixa, 4.0.0, isto koristi mmg i izbaci sve što ti ne treba pa remuxaj (
http://www.bunkus.org/videotools/mkvtoolnix/win32/), ili ako koristiš noviju verziju prije remuxanja za video i audio pod
Extra options za
Compression odaberi
none pa javi da li sada radi.