dva diska a ovaj drugi je sa podacima za sačuvati...pa jednostavno isključi kablove sa tog drugog i instaliraj na onaj sistemski disk nanovo...možeš izabrati i opravku postojećeg sistema ako misliš da ima podataka na sistemskom disku kojeg radiš a rado bi ih spasio.Kad bude instalacija gotova isključi PC i priključi taj drugi disk sa podacima.
ps:
jesi probao bootati sa instalacijskog i doći do CMD prompta pa odraditi CHKDSK ( to ti je drugi ponuđeni R

...često nakon toga XP proradi ).