I ja sam instaliravao distre na komp s isključenim AHCI bez problema, probaj ponovo instalaciju, možda nisi dobro odabrao drivere. Ili probaj neku drugu distru.
Također sam imao situacije kad sam instaliro OSX s uključenim AHCI, a onda ga disableao i radilo bi mi sve ok.
Probaj nakon disejblanja AHCIa bootati OSX instalaciju s instalacijskog DVD-a, uz -f -v -x.
A ako baš hoćeš AHCI, ili ne uspiješ drugačije, možeš se pozabaviti i ovim (nisam radio ovo pa ne mogu govoriti iz iskustva):
Enable AHCI mode after installing Windows