Nisam vidio da neki "boot virus" može ostati nakon formatiranja, ali ima virusa koji unište MBR ili MFT pa je potrebno "krpati" ili formatirati. Međutim, takvih virusa nema puno i nisu prošireni. Isto tako se virus može preseliti na drugu particiju koju ne formatiraš...
U RAM naravno da može, ali to onda nestaje nakon isključivanja kompa. Iako ne znam na što si točno mislio pod RAM jer sve štetočine koje su aktivne s ostalim procesima su također u RAM-u.
Ima još virusa koji napadaju BIOS i onda ga koruptiraju ili naprave neku drugu štetu. U tim slučajima pomaže uglavnom flashanje.